Análisis a fondo · 13 min de lectura

Genes de la enfermedad celíaca en sus datos de ADN en bruto: HLA-DQ2.5 (rs2187668), DQ8 (rs7454108) y lo que no pueden decirle

Encuentre rs2187668 (HLA-DQ2.5) y rs7454108 (DQ8) en un archivo en bruto de 23andMe o AncestryDNA, léalos en una tabla de genotipos y entienda por qué un resultado negativo es el que resulta útil.

Floriel FedryCo-founder & Software Engineer

Su archivo en bruto de 23andMe o AncestryDNA contiene las dos variantes que marcan los principales haplotipos de la enfermedad celíaca: rs2187668 para HLA-DQ2.5 y rs7454108 para HLA-DQ8. Busque ambas en el archivo, lea la pareja en la tabla de abajo y sabrá si las porta. La mayoría de los portadores nunca desarrollan la enfermedad celíaca, así que la respuesta útil es la negativa; una positiva es una pregunta para un médico, no un motivo para cambiar de dieta.

Por qué la mayoría de las personas con los genes de la enfermedad celíaca nunca la desarrollan

La enfermedad celíaca es una reacción inmunitaria al gluten que daña el revestimiento del intestino delgado. Afecta aproximadamente al 1 % de la población mundial, y muchas de esas personas no están diagnosticadas (NIDDK, consultado el 14 de octubre de 2026).

Casi nunca aparece en personas que no tienen ninguno de los dos grupos de variantes HLA, DQ2 y DQ8, que dan forma a las moléculas inmunitarias que presentan los fragmentos de gluten a los linfocitos T. Estas variantes son frecuentes. El NIDDK indica que «alrededor del 30 por ciento de las personas tienen DQ2 o DQ8» y que «solo alrededor del 3 por ciento de las personas con DQ2 o DQ8 desarrollan la enfermedad celíaca» (NIDDK, consultado el 14 de octubre de 2026); una revisión de 2020 sitúa la proporción de portadores entre el 30 % y el 40 % de la población general de Norteamérica y Europa, y en torno al 3 % de los portadores desarrolla la enfermedad (Poddighe et al., World Journal of Gastroenterology 2020). La aritmética importa: si un tercio de las personas porta estas variantes y el 1 % tiene la enfermedad, unos 3 portadores de cada 100 están afectados y 97 no. Los genes son casi necesarios, pero están lejos de ser suficientes; el gluten es el desencadenante, y el resto no se comprende bien (Aboulaghras et al., International Journal of Molecular Sciences 2023).

DQ2 existe en varias formas. DQ2.5 (la pareja DQA1*05:01 y DQB1*02:01) se encuentra en aproximadamente el 90 % de los pacientes y DQ8 (DQB1*03:02) en aproximadamente el 5 % (Aboulaghras et al. 2023); casi el 95 % de los pacientes porta al menos una de las dos (Monsuur et al., PLoS ONE 2008). El resto porta sobre todo DQ2.2 o la mitad de la molécula DQ2, lo que importa para la laguna que se describe más abajo.

Los dos SNP marcadores: rs2187668 y rs7454108

Un chip de consumo no lee los propios genes HLA. Lee posiciones aisladas cercanas que se heredan junto con un haplotipo, llamadas SNP marcadores (tag SNPs). Monsuur y sus colegas demostraron que seis de estos SNP predicen los tipos DQ2.5, DQ2.2, DQ7 y DQ8 con una sensibilidad superior a 0,991 y una especificidad superior a 0,996 frente al tipaje HLA clásico (Monsuur et al. 2008). Dos de los seis son los que 23andMe lee en su informe sobre la enfermedad celíaca (23andMe for Healthcare Professionals, octubre de 2017, consultado el 14 de octubre de 2026):

  • rs2187668 marca DQ2.5. Se encuentra en HLA-DQA1, en el cromosoma 6, posición 32 605 884 del ensamblaje GRCh37, el que usan los archivos de consumo, con los alelos C y T (Ensembl GRCh37, consultado el 14 de octubre de 2026). La tabla de Monsuur da T como alelo marcador. SNPedia describe este SNP en orientación negativa y llama A al mismo alelo (SNPedia rs2187668), al igual que el GWAS Catalog, pero 23andMe «informa de todos los datos de genotipo sobre la hebra positiva de GRCh37» (página de SNPedia sobre la orientación), así que en su archivo el alelo DQ2.5 es T.
  • rs7454108 marca DQ8. Está cerca de HLA-DQB1, en la posición 32 681 483 de GRCh37, con los alelos T y C (Ensembl GRCh37). Es un SNP de orientación positiva, así que C marca DQB1*03:02 en su archivo, en SNPedia y en el catálogo por igual (SNPedia rs7454108).

La tabla usa las letras tal como las imprime un archivo de 23andMe, en orden alfabético, así que espere ver CT en lugar de TC. Las frecuencias son los porcentajes HapMap CEU de las dos páginas de SNPedia, una pequeña muestra europea. Las listas de chips de SNPedia incluyen ambos SNP en los chips v3 a v5 de 23andMe y en los chips v2 de Ancestry, así que un archivo de cualquiera de las dos empresas debería contenerlos.

SNPSu genotipoQué significaFrecuencia (CEU)
rs2187668CCSin DQ2.584 %
rs2187668CTUna copia de DQ2.516 %
rs2187668TTDos copias de DQ2.5Rara; muy por debajo del 1 %
rs7454108TTSin DQ867 %
rs7454108CTUna copia de DQ829 %
rs7454108CCDos copias de DQ83,5 %

CC en el primero y TT en el segundo significa que no porta ninguno de los dos haplotipos, el resultado más valioso, por la razón que se explica en el apartado sobre las limitaciones.

La laguna de DQ2.2 y qué más se les escapa a dos SNP

Dos SNP cubren DQ2.5 y DQ8. No detectan DQ2.2 (la pareja DQA1*02:01 y DQB1*02:02), la forma de DQ2 de menor riesgo, que explica la mayoría de los pacientes que no tienen ninguno de los dos haplotipos principales. En una cohorte europea de 1008 pacientes celíacos, 61 (el 6 %) no tenían ni DQ2.5 ni DQ8; 57 de ellos portaban la mitad de la molécula DQ2, y solo 4 pacientes de toda la cohorte no portaban ninguna parte de ella (Karell et al., Human Immunology 2003).

Determinar DQ2.2 a partir de un archivo en bruto exige leer juntos tres SNP, rs2395182, rs7775228 y rs4713586, el panel que usó Monsuur; el genoset gs221 de SNPedia codifica la combinación (SNPedia gs221). SNPedia solo incluye el tercero en el chip v5 de 23andMe (no en el v3 ni en el v4) y en los chips v2 de Ancestry, y es un SNP de orientación negativa cuyas letras hay que invertir primero, así que aquí no damos una tabla de DQ2.2. La consecuencia práctica: CC en rs2187668 y TT en rs7454108 significa «ni DQ2.5 ni DQ8», no «ningún gen de la enfermedad celíaca». El informe de 23andMe tiene el mismo alcance de dos variantes; su nota al pie dice que la prueba «no está destinada a diagnosticar ninguna enfermedad» y que el informe «no cubre la sensibilidad al gluten no celíaca» (23andMe for Healthcare Professionals).

Cómo encontrarlas en su archivo sin subirlo

  1. Abra el archivo en un editor de texto plano. Descomprima la descarga (nuestra guía de descarga explica cada proveedor) y abra el .txt (23andMe, AncestryDNA) o el .csv (MyHeritage) en TextEdit, el Bloc de notas o un editor de código, no en Excel, que puede cambiar el formato de los valores.
  2. Busque rs2187668. Una línea de 23andMe tiene este aspecto: rs2187668 6 32605884 CT; una línea de AncestryDNA lo divide en dos columnas, C y T. Anote las letras y luego busque rs7454108.
  3. Lea ambas en la tabla de arriba. Si una línea muestra -- (23andMe) o 0 0 (Ancestry), el chip no leyó esa posición y el archivo no puede responder.

Nuestra guía para leer un archivo de datos de ADN en bruto explica las columnas, el ensamblaje GRCh37, la orientación de las hebras y las posiciones sin lectura (no-calls).

Qué dice la evidencia GWAS y cómo la trata nuestro informe

El GWAS Catalog, la base de datos en la que se basan nuestros informes, recogía 16 asociaciones para rs2187668 (GWAS Catalog rs2187668, consultado el 14 de octubre de 2026). Dos corresponden a la enfermedad celíaca: una razón de posibilidades (odds ratio, OR) de 7,04 en el primer GWAS sobre la enfermedad celíaca (van Heel et al., Nature Genetics 2007) y de 6,23 en su sucesor de 2010 (Dubois et al., Nature Genetics 2010). La mayoría de las demás son afecciones inmunitarias que van asociadas al mismo haplotipo, como el lupus, la hepatitis autoinmune y la sarcoidosis. rs7454108 tiene 4, entre ellas una fila de vasculitis (odds ratio de 2,73), la que llega a nuestro catálogo (GWAS Catalog rs7454108). Un odds ratio de 7 describe las posibilidades de los portadores frente a los no portadores, no un riesgo multiplicado por 7 para usted; la cifra del 3 % de más arriba es lo que eso supone en términos absolutos.

Nuestro catálogo de salud (versión del 1 de junio de 2026) conserva las filas que superan el filtro de la metodología, una variante principal por región para cada afección: para rs2187668, exactamente tres filas, las dos filas de la enfermedad celíaca y una de lupus eritematoso cutáneo (PubMed 25827949), y para rs7454108, la fila de vasculitis. La propia afección de la enfermedad celíaca se basa en las 23 filas de enfermedad celíaca del catálogo. Una 24.ª fila de enfermedad celíaca, rs2041570-A, de un estudio sobre la enfermedad celíaca refractaria de tipo II (PubMed 29787419), está asignada a la enfermedad celíaca refractaria y se imprime como una afección propia, Enfermedad celíaca refractaria. El informe nutricional no puntúa estas filas: lee los SNP marcadores de Monsuur en una ficha de gen que indica qué tipos HLA asociados a la enfermedad celíaca muestra su archivo, y que esto no es un diagnóstico.

Dos salvedades sobre cómo llegan esas filas a su PDF. Primero, la hebra. El catálogo escribe A como alelo de riesgo celíaco de rs2187668, la letra de la hebra negativa, mientras que su archivo imprime C o T. Nuestro generador cuenta una lectura en la hebra de ADN con la que encaja, y para esta variante el resultado es el siguiente. Una lectura CT contiene T, el complemento de A, junto con otra base, así que se lee en la otra hebra y cuenta una copia, que aparece en la tabla de la enfermedad celíaca como alelo de riesgo T con una odds ratio de 6,23 y una frecuencia de 0,26 (Dubois et al. 2010). Una lectura CC no contiene ninguna de las dos bases y cuenta cero copias, por debajo de la media, sin fila. Una lectura TT, formada solo por la base complementaria, no puede situarse en ninguna hebra y no se contabiliza en absoluto. Así, la tendencia de la enfermedad celíaca cuenta una única copia de DQ2.5, pero en un archivo con dos copias deja fuera rs2187668; lea su estado de DQ2.5 en la tabla de arriba y no en la tendencia. La fila de lupus eritematoso cutáneo figura como T y coincide tal cual con un portador de DQ2.5, y la fila rs7454108-C coincide, como cabe esperar, con un archivo CT o CC. Segundo, el texto de la afección está clasificado en la sección Enfermedades congénitas del informe de salud completo, mientras que el lupus eritematoso cutáneo y la vasculitis aparecen en Enfermedades autoinmunes e inflamatorias. Cada fila muestra el rsID, su genotipo, el alelo de riesgo, sus copias de ese alelo, la frecuencia del alelo, la odds ratio por copia y los enlaces a PubMed (vea el informe de ejemplo); la tendencia compara sus copias con las de la persona media, conserva una variante principal por región, toma un estudio por variante y no usa ningún riesgo basal, así que es una asociación, no una puntuación de riesgo. Como con APOE, es la fila la que le dice algo.

Lo que el resultado no puede decirle

  • Un marcador no es el gen. El panel de Monsuur se desarrolló en cohortes neerlandesas y se comprobó en muestras británicas, españolas e italianas; el ligamiento entre un SNP marcador y un haplotipo puede ser distinto en otras poblaciones, y por eso 23andMe dice que su informe es más pertinente para personas de ascendencia europea.
  • La mitad útil es el negativo. La prueba HLA de la enfermedad celíaca «tiene un valor predictivo positivo bajo, pero un valor predictivo negativo alto» (Aboulaghras et al. 2023); el NIDDK lo formula así: «si no tiene estas variantes genéticas, es muy poco probable que tenga la enfermedad celíaca» y «tener DQ2 o DQ8 por sí solo no significa que tenga la enfermedad celíaca» (página del NIDDK sobre el diagnóstico, consultado el 14 de octubre de 2026). Con la laguna de DQ2.2, un negativo en un archivo de consumo es algo menos sólido que uno de laboratorio.
  • Los síntomas son cosa de la serología, no de un archivo en bruto. La prueba de primera línea es la de anticuerpos IgA antitransglutaminasa tisular (tTG-IgA), positiva en aproximadamente el 93 % de los pacientes que siguen una dieta con gluten y negativa en aproximadamente el 96 % de las personas sin la enfermedad; una biopsia del intestino delgado confirma el diagnóstico (Celiac Disease Foundation, consultado el 14 de octubre de 2026). La prueba de anticuerpos solo funciona mientras se come gluten, y el NIDDK señala que los médicos «no recomiendan empezar una dieta sin gluten antes de las pruebas diagnósticas». Si tiene síntomas, consulte a un médico o a un gastroenterólogo, con las dos líneas de su archivo como contexto. Cada haplotipo procede de uno de los progenitores, así que un resultado positivo también aporta información sobre sus hermanos y sus hijos.

Preguntas frecuentes

¿Analiza 23andMe la enfermedad celíaca?

Sí, de dos maneras. El informe de riesgo genético de enfermedad celíaca (Celiac Disease Genetic Health Risk), uno de los diez informes que la FDA autorizó el 6 de abril de 2017 (nota de prensa de 23andMe, consultado el 14 de octubre de 2026), lee rs2187668 y rs7454108 y, en el momento de escribir esto, solo se vende con el servicio Health en ocho países. Además, el archivo en bruto de cada cliente contiene ambos rsID, así que incluso un kit solo de orígenes le da las dos letras.

¿Cuántos genes intervienen en la enfermedad celíaca?

HLA-DQ es, con diferencia, el más fuerte, y por eso dos SNP marcadores ya aportan información. Más allá de él, un genotipado denso elevó en 2011 a 40 el número de loci de riesgo conocidos, HLA incluido, cada uno de los demás con un efecto pequeño (Trynka et al., Nature Genetics 2011). Nuestro catálogo de salud conserva la variante principal de la enfermedad celíaca de cada región, cada una enlazada a su estudio.

¿Se puede tener la enfermedad celíaca sin el gen?

Rara vez. En 1008 pacientes europeos, el 6 % no tenía ni DQ2.5 ni DQ8, pero casi todos ellos portaban la mitad de la molécula DQ2, y solo 4 pacientes no portaban ninguna parte de ella (Karell et al. 2003). Los dos SNP de consumo no ven ese grupo de media molécula DQ2 o DQ2.2, así que «negativo en mi archivo» no equivale del todo a «ningún gen de la enfermedad celíaca»; una prueba HLA de laboratorio es la versión más estricta.

¿Debo dejar el gluten si porto DQ2 o DQ8?

No solo por el gen. Aproximadamente el 97 % de los portadores nunca desarrolla la enfermedad celíaca, y dejar el gluten antes de hacerse las pruebas hace que la prueba de anticuerpos no sea fiable, lo que puede dejar sin diagnosticar un caso real. Si tiene síntomas o antecedentes familiares, pida a un médico una prueba de tTG-IgA mientras todavía come gluten, y lleve a esa cita las dos líneas de su archivo.

Este artículo tiene únicamente fines informativos generales y no constituye consejo médico. Consulte a un profesional sanitario cualificado antes de tomar decisiones de salud basadas en datos genéticos.

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