Geni della celiachia nei Suoi dati grezzi del DNA: HLA-DQ2.5 (rs2187668), DQ8 (rs7454108) e che cosa non Le possono dire

Il Suo file di dati grezzi di 23andMe o AncestryDNA contiene le due varianti che marcano i principali aplotipi della celiachia: rs2187668 per HLA-DQ2.5 e rs7454108 per HLA-DQ8. Le cerchi entrambe nel file, legga la coppia di lettere nella tabella qui sotto e saprà se le porta. La maggior parte dei portatori non sviluppa mai la celiachia, quindi la risposta utile è quella negativa; una risposta positiva è una domanda da porre a un medico, non un motivo per cambiare alimentazione.

Perché la maggior parte delle persone con i geni della celiachia non si ammala mai#

La celiachia è una reazione immunitaria al glutine che danneggia la mucosa dell'intestino tenue. Colpisce circa l'1% della popolazione mondiale, e molte di queste persone non hanno una diagnosi (NIDDK, consultato il 14 ottobre 2026).

Non si manifesta quasi mai in chi non ha nessuno dei due gruppi di varianti HLA, DQ2 e DQ8, che determinano la forma delle molecole immunitarie che presentano i frammenti di glutine ai linfociti T. Queste varianti sono comuni. Il NIDDK afferma che «circa il 30 per cento delle persone ha DQ2 o DQ8» e che «solo circa il 3 per cento delle persone con DQ2 o DQ8 sviluppa la celiachia» (NIDDK, consultato il 14 ottobre 2026); una revisione del 2020 stima la quota di portatori tra il 30% e il 40% della popolazione generale in Nord America e in Europa, con circa il 3% dei portatori che sviluppa la malattia (Poddighe et al., World Journal of Gastroenterology 2020). I numeri contano: se un terzo delle persone porta queste varianti e l'1% ha la malattia, circa 3 portatori su 100 si ammalano e 97 no. I geni sono quasi necessari, ma tutt'altro che sufficienti; il glutine è il fattore scatenante, e il resto non è ben compreso (Aboulaghras et al., International Journal of Molecular Sciences 2023).

DQ2 esiste in diverse forme. DQ2.5 (la coppia DQA1*05:01 e DQB1*02:01) si trova in circa il 90% dei pazienti e DQ8 (DQB1*03:02) in circa il 5% (Aboulaghras et al. 2023); quasi il 95% dei pazienti porta almeno uno dei due (Monsuur et al., PLoS ONE 2008). Gli altri portano per lo più DQ2.2 o metà della molecola DQ2, il che conta per la lacuna descritta più avanti.

I due SNP marcatori: rs2187668 e rs7454108#

Un chip dei test commerciali non legge direttamente i geni HLA. Legge singole posizioni vicine che si ereditano insieme a un aplotipo, chiamate SNP marcatori (tag SNP). Monsuur e colleghi hanno dimostrato che sei di questi SNP predicono i tipi DQ2.5, DQ2.2, DQ7 e DQ8 con una sensibilità superiore a 0,991 e una specificità superiore a 0,996 rispetto alla tipizzazione HLA classica (Monsuur et al. 2008). Due dei sei sono quelli che 23andMe legge nel suo report sulla celiachia (23andMe for Healthcare Professionals, ottobre 2017, consultato il 14 ottobre 2026):

• rs2187668 marca DQ2.5. Si trova in HLA-DQA1 sul cromosoma 6, in posizione 32.605.884 sulla build GRCh37, quella usata dai file dei test commerciali, con gli alleli C e T (Ensembl GRCh37, consultato il 14 ottobre 2026). La tabella di Monsuur indica T come allele marcatore. SNPedia descrive lo SNP con orientamento negativo e chiama lo stesso allele A (SNPedia rs2187668), come fa il GWAS Catalog, ma 23andMe «riporta tutti i dati di genotipo sul filamento positivo di GRCh37» (pagina di SNPedia sull'orientamento), quindi nel Suo file l'allele DQ2.5 è T.
• rs7454108 marca DQ8. Si trova vicino a HLA-DQB1, in posizione 32.681.483 su GRCh37, con gli alleli T e C (Ensembl GRCh37). È uno SNP con orientamento positivo, quindi C marca DQB1*03:02 nel Suo file, su SNPedia e nel catalogo allo stesso modo (SNPedia rs7454108).

La tabella usa le lettere come le scrive un file di 23andMe, in ordine alfabetico: si aspetti quindi CT e non TC. Le frequenze sono le percentuali HapMap CEU riportate nelle due pagine di SNPedia, un piccolo campione europeo. Gli elenchi dei chip di SNPedia indicano entrambi gli SNP sui chip da v3 a v5 di 23andMe e sui chip v2 di Ancestry, quindi un file di una delle due aziende dovrebbe contenerli.

CC al primo e TT al secondo significano nessuno dei due aplotipi: è il risultato più prezioso, per il motivo spiegato nella parte sui limiti.

La lacuna DQ2.2, e che cos'altro sfugge a due SNP#

Due SNP coprono DQ2.5 e DQ8. Non rilevano DQ2.2 (la coppia DQA1*02:01 e DQB1*02:02), la forma di DQ2 a rischio più basso che riguarda la maggior parte dei pazienti senza nessuno dei due aplotipi principali. In una coorte europea di 1.008 pazienti celiaci, 61 (6%) non avevano né DQ2.5 né DQ8; 57 di loro portavano metà della molecola DQ2, e solo 4 pazienti dell'intera coorte non ne portavano alcuna parte (Karell et al., Human Immunology 2003).

Per determinare DQ2.2 da un file di dati grezzi bisogna leggere insieme tre SNP, rs2395182, rs7775228 e rs4713586, il pannello usato da Monsuur; il genoset gs221 di SNPedia codifica questa combinazione (SNPedia gs221). SNPedia indica il terzo solo sul chip v5 di 23andMe (non su v3 né su v4) e sui chip v2 di Ancestry, ed è uno SNP con orientamento negativo le cui lettere vanno prima invertite: per questo qui non diamo una tabella per DQ2.2. La conseguenza pratica: CC in rs2187668 più TT in rs7454108 significa «niente DQ2.5 e niente DQ8», non «nessun gene della celiachia». Il report di 23andMe ha la stessa portata limitata a due varianti; la sua nota a piè di pagina precisa che il test «non è destinato a diagnosticare alcuna malattia» e che il report «non riguarda la sensibilità al glutine non celiaca» (23andMe for Healthcare Professionals).

Come trovarli nel Suo file senza caricarlo#

1. Apra il file in un semplice editor di testo. Decomprima il download (la nostra guida al download spiega la procedura per ogni servizio) e apra il .txt (23andMe, AncestryDNA) o il .csv (MyHeritage) con TextEdit, Blocco note o un editor di codice, non con Excel, che può riformattare i valori.
2. Cerchi rs2187668. Una riga di 23andMe si presenta così: rs2187668 6 32605884 CT; una riga di AncestryDNA divide il genotipo in due colonne, C e T. Annoti le lettere, poi cerchi rs7454108.
3. Legga entrambi nella tabella qui sopra. Se una riga mostra -- (23andMe) o 0 0 (Ancestry), il chip non ha letto quella posizione e il file non può dare una risposta.

La nostra guida per leggere un file di dati grezzi del DNA spiega le colonne, la build GRCh37, l'orientamento del filamento e i no-call (posizioni non lette).

Che cosa dicono i dati GWAS, e come li tratta il nostro report#

Il GWAS Catalog, la banca dati su cui si basano i nostri report, elencava 16 associazioni per rs2187668 (GWAS Catalog rs2187668, consultato il 14 ottobre 2026). Due riguardano la celiachia: un odds ratio di 7,04 nel primo GWAS sulla celiachia (van Heel et al., Nature Genetics 2007) e di 6,23 nel suo successore del 2010 (Dubois et al., Nature Genetics 2010). La maggior parte delle altre sono patologie immunitarie che accompagnano lo stesso aplotipo, come il lupus, l'epatite autoimmune e la sarcoidosi. rs7454108 ne ha 4, tra cui una riga sulla vasculite (odds ratio 2,73), quella che entra nel nostro catalogo (GWAS Catalog rs7454108). Un odds ratio di 7 descrive l'odds dei portatori rispetto ai non portatori, non un rischio 7 volte più alto per Lei; il dato del 3% riportato sopra mostra che cosa significa in termini assoluti.

Il nostro catalogo per la salute (versione 2026-06-01) mantiene le righe che superano il filtro descritto nella metodologia, una variante principale per regione per ogni patologia: per rs2187668 esattamente tre righe, le due righe sulla celiachia e una riga sul lupus eritematoso cutaneo (PubMed 25827949), e per rs7454108 la riga sulla vasculite. La patologia celiachia si basa sulle 23 righe del catalogo dedicate alla celiachia. Una 24ª riga sulla celiachia, rs2041570-A, da uno studio sulla celiachia refrattaria di tipo II (PubMed 29787419), è attribuita alla celiachia refrattaria e compare come patologia a sé, Celiachia refrattaria. Il report nutrizionale non assegna un punteggio a queste righe: legge gli SNP marcatori di Monsuur in una scheda gene che indica quali tipi HLA associati alla celiachia mostra il Suo file, e precisa che non è una diagnosi.

Due avvertenze su come queste righe arrivano nel Suo PDF. La prima riguarda il filamento. Il catalogo scrive l'allele di rischio della celiachia di rs2187668 come A, la lettera del filamento negativo, mentre il Suo file riporta C o T. Il nostro generatore conta una lettura sul filamento del DNA a cui corrisponde, e per questa variante il risultato è il seguente. Una lettura CT contiene T, il complemento di A, insieme a un'altra base, quindi viene letta sull'altro filamento e conta una copia, mostrata nella tabella della celiachia come allele di rischio T con un odds ratio di 6,23 e una frequenza di 0,26 (Dubois et al. 2010). Una lettura CC non contiene nessuna delle due basi e conta zero copie, sotto la media, senza una riga. Una lettura TT, composta solo dalla base complementare, non può essere collocata su nessun filamento e non viene conteggiata affatto. La tendenza della celiachia conta quindi una singola copia di DQ2.5, ma per un file con due copie lascia fuori rs2187668: legga il Suo stato DQ2.5 nella tabella qui sopra anziché nella tendenza. La riga sul lupus eritematoso cutaneo è riportata come T e corrisponde così com'è a un portatore di DQ2.5, e la riga rs7454108-C corrisponde come previsto a un file CT o CC. La seconda: il testo della patologia è classificato nella sezione Malattie congenite del report completo sulla salute, mentre il lupus eritematoso cutaneo e la vasculite compaiono in Malattie autoimmuni e infiammatorie. Ogni riga mostra l'rsID, il Suo genotipo, l'allele di rischio, le Sue copie di quell'allele, la sua frequenza, l'odds ratio per copia e i link a PubMed (veda il report di esempio); la tendenza confronta le Sue copie con quelle della persona media, mantiene una variante principale per regione, prende uno studio per variante e non usa alcun rischio di base, quindi è un'associazione, non un punteggio di rischio. Come per APOE, è la riga a dirLe qualcosa.

Che cosa il risultato non Le può dire#

• Un marcatore non è il gene. Il pannello di Monsuur è stato sviluppato su coorti olandesi e verificato su campioni britannici, spagnoli e italiani; il legame tra uno SNP marcatore e un aplotipo può essere diverso altrove, ed è per questo che 23andMe afferma che il suo report è più pertinente per le persone di origine europea.
• È il negativo la metà utile. Il test HLA per la celiachia «ha un basso valore predittivo positivo ma un alto valore predittivo negativo» (Aboulaghras et al. 2023); il NIDDK lo formula così: «se non ha queste varianti genetiche, è molto improbabile che abbia la celiachia» e «avere solo DQ2 o DQ8 non significa avere la celiachia» (pagina del NIDDK sulla diagnosi, consultato il 14 ottobre 2026). Con la lacuna DQ2.2, un negativo ricavato da un file di un test commerciale è un po' meno solido di uno di laboratorio.
• I sintomi sono materia della sierologia, non di un file di dati grezzi. Il test di primo livello è la ricerca degli anticorpi IgA anti-transglutaminasi tissutale (tTG-IgA), positiva in circa il 93% dei pazienti che seguono una dieta con glutine e negativa in circa il 96% delle persone senza la malattia; una biopsia dell'intestino tenue conferma la diagnosi (Celiac Disease Foundation, consultato il 14 ottobre 2026). Il test degli anticorpi funziona solo finché si mangia glutine, e il NIDDK osserva che i medici «non raccomandano di iniziare una dieta senza glutine prima degli esami diagnostici». Se ha sintomi, si rivolga a un medico o a un gastroenterologo, portando come contesto le due righe del Suo file. Ogni aplotipo viene da un genitore, quindi un risultato positivo è un'informazione anche su fratelli, sorelle e figli.

Domande frequenti#

23andMe fa il test per la celiachia?

Sì, in due modi. Il report Celiac Disease Genetic Health Risk, uno dei dieci report autorizzati dalla FDA il 6 aprile 2017 (comunicato stampa di 23andMe, consultato il 14 ottobre 2026), legge rs2187668 e rs7454108 ed è venduto, al momento in cui scriviamo, solo con il servizio Health in otto paesi. Inoltre, il file di dati grezzi di ogni cliente contiene entrambi gli rsID, quindi anche un kit solo per le origini Le fornisce le due lettere.

Quanti geni sono coinvolti nella celiachia?

HLA-DQ è di gran lunga il più forte, ed è per questo che due SNP marcatori bastano a dare un'informazione. Al di là di HLA-DQ, una genotipizzazione densa ha portato nel 2011 il numero di loci di rischio noti, HLA compreso, a 40, ciascuno degli altri con un effetto piccolo (Trynka et al., Nature Genetics 2011). Il nostro catalogo per la salute mantiene la variante principale della celiachia di ogni regione, ciascuna collegata al proprio studio.

Si può avere la celiachia senza il gene?

Raramente. Su 1.008 pazienti europei, il 6% non aveva né DQ2.5 né DQ8, ma quasi tutti portavano metà della molecola DQ2, e solo 4 pazienti non ne portavano alcuna parte (Karell et al. 2003). I due SNP dei test commerciali non vedono il gruppo con metà di DQ2 o con DQ2.2, quindi «negativo nel mio file» non equivale del tutto a «nessun gene della celiachia»; un test HLA di laboratorio ne è la versione più rigorosa.

Devo smettere di mangiare glutine se porto DQ2 o DQ8?

Non sulla base del solo gene. Circa il 97% dei portatori non sviluppa mai la celiachia, e passare a una dieta senza glutine prima degli esami rende inaffidabile il test degli anticorpi, il che può lasciare senza diagnosi un caso reale. Se ha sintomi o una storia familiare, chieda a un medico un test tTG-IgA mentre mangia ancora glutine, e porti a quell'appuntamento le due righe del Suo file.