Comment vérifier MTHFR dans vos données brutes 23andMe, et ce que les preuves permettent d'affirmer

Votre fichier brut 23andMe contient les deux variants courants de MTHFR : C677T est rs1801133 et A1298C est rs1801131. Cherchez chaque rsID dans le fichier et lisez les lettres dans le tableau ci-dessous, en gardant à l'esprit que 23andMe imprime le brin plus : C677T y apparaît donc sous la forme A, et non T. Lisez ensuite la section sur les preuves : la plupart des affirmations de santé associées à MTHFR en ligne ne sont pas étayées. Notre rapport de santé n'évalue aucun des deux variants ; notre rapport nutrition présente C677T dans une fiche gène, avec ce que de grandes études ont trouvé pour le folate et l'homocystéine, et laisse A1298C de côté.

Ce que sont MTHFR C677T et A1298C#

MTHFR est un gène du chromosome 1 qui code la méthylènetétrahydrofolate réductase, une enzyme qui convertit une forme de folate en celle qui circule dans le sang et sert à transformer l'homocystéine en méthionine (MedlinePlus Genetics, consulté le 14 octobre 2026). Deux variants courants changent chacun un acide aminé. C677T (rs1801133) produit une enzyme dont l'activité diminue aux températures plus élevées, et les personnes qui en portent deux copies ont tendance à avoir une homocystéine un peu plus élevée. A1298C (rs1801131) n'a pas été associé de façon constante, à lui seul, à une homocystéine plus élevée, selon la revue de 23andMe ; il pourrait compter lorsqu'il est présent avec C677T.

Ce sont deux polymorphismes courants, pas des mutations rares. Les fréquences alléliques de 1000 Genomes, lues sur Ensembl GRCh37 (rs1801133, rs1801131, consulté le 14 octobre 2026) :

À ces fréquences, environ 13 % des Européens et une personne sur cinq d'ascendance américaine métissée portent deux copies de 677T, et environ 60 % des Européens en portent au moins une. MedlinePlus estime les porteurs de deux copies à « environ 25 % des Hispaniques et 10 à 15 % des Blancs nord-américains ». « Avoir MTHFR » décrit la majorité de la population.

Comment les trouver dans votre fichier 23andMe#

Vous n'avez besoin d'aucun site web pour cela. Trois étapes :

1. Ouvrez le fichier dans un éditeur de texte. Décompressez le téléchargement (voir notre guide de téléchargement) et ouvrez le .txt dans TextEdit, le Bloc-notes ou un éditeur de code, pas dans un tableur.
2. Cherchez rs1801133. La ligne ressemble à rs1801133 1 11856378 AG : rsID, chromosome 1, position sur l'assemblage GRCh37, génotype. Notez les deux lettres.
3. Cherchez rs1801131. La ligne ressemble à rs1801131 1 11854476 GT. Notez les lettres et lisez les deux dans le tableau ci-dessous.

La question du brin compte ici. Le gène MTHFR se lit sur le brin inverse du chromosome 1 (Ensembl GRCh37 l'indique sur le brin −1), mais 23andMe rapporte chaque génotype sur le brin plus de l'assemblage 37 ; l'en-tête de votre propre fichier brut le précise. Les noms C677T et A1298C utilisent les lettres propres au gène : dans un fichier 23andMe, le C de C677T est donc un G et le T un A, et le A de A1298C est un T et le C un G. SNPedia indique rs1801133 comme un SNP d'orientation moins pour la même raison (consulté le 14 octobre 2026).

23andMe imprime les deux lettres d'un appel par ordre alphabétique : attendez-vous donc à AG plutôt qu'à GA, et -- signifie que la puce n'a pas pu lire cette position. Les étiquettes de puces de SNPedia indiquent rs1801133 sur toutes les puces 23andMe, de la v1 à la v5, et sur les puces v2 d'Ancestry. Un fichier AncestryDNA répartit le génotype sur deux colonnes ; vérifiez la mention du brin dans son en-tête avant d'utiliser le tableau. Notre guide pour lire un fichier de données ADN brutes explique les colonnes, les assemblages et les no-calls.

Ce que montrent réellement les preuves#

Commençons par ce qui est solide. C677T augmente modestement l'homocystéine : la revue de la littérature de 23andMe l'estime à environ 10 % de plus avec une copie et environ 30 % avec deux, la plupart des porteurs restant dans les valeurs normales (23andMe, « Our take on the MTHFR gene », mis à jour le 14 mars 2025, consulté le 14 octobre 2026). Le MTHFR Studies Collaborative Group a chiffré la différence entre TT et CC à environ 20 % dans les populations étudiées (Clarke et al., PLoS Medicine 2012).

Vient ensuite ce qui compte : cela se traduit-il par des maladies ? La même étude de 2012 en est le test le plus net. Dans 19 jeux de données non publiés totalisant 48 175 cas de maladie coronarienne et 67 961 témoins, l'odds ratio de TT par rapport à CC était de 1,02 (IC à 95 % 0,98–1,07). Dans les 86 études publiées, il était de 1,15 ; les auteurs ont attribué cet écart au biais de publication et conclu qu'une élévation modérée de l'homocystéine tout au long de la vie a peu ou pas d'effet sur la maladie coronarienne.

Les sociétés savantes en ont tiré la conséquence il y a dix ans. L'American College of Medical Genetics and Genomics a publié en 2013 une recommandation de pratique indiquant que les méta-analyses n'avaient trouvé aucune association entre le statut des polymorphismes MTHFR et la maladie thromboembolique veineuse, que le test a une utilité clinique minime et qu'il ne devrait pas être prescrit dans le cadre d'un bilan de thrombophilie de routine (Hickey, Curry et Toriello, Genetics in Medicine 2013). En juillet 2015, l'ACMG l'a inscrit sur sa liste Choosing Wisely : « Ne prescrivez pas de test génétique MTHFR pour évaluer le risque de thrombophilie héréditaire » (rapport de l'ACMG, septembre 2015, hébergé par le NHGRI, consulté le 14 octobre 2026).

La revue de 23andMe arrive à la même conclusion : les variants courants « ne devraient pas être interprétés comme ayant un effet significatif sur la santé », car pour la plupart des affections étudiées, les preuves sont « non concluantes ou contradictoires ». Elle cite deux exceptions. Les personnes portant deux copies de C677T semblent avoir un risque légèrement plus élevé de grossesse touchée par une anomalie du tube neural, ce risque restant globalement très faible ; et une poignée de variants MTHFR rares, différents, causent l'homocystinurie, une maladie grave qui touche moins d'une personne sur 200 000. MedlinePlus rejoint ce constat pour les anomalies du tube neural et décrit les autres associations étudiées, des caillots sanguins aux troubles psychiatriques et au cancer, comme ayant donné des résultats mitigés.

Pourquoi les rapports fondés sur les GWAS n'évaluent pas MTHFR, et ce que montre notre rapport nutrition#

Le GWAS Catalog est le registre public des études d'association pangénomique sur lequel reposent nos rapports. MTHFR y figure, mais pas pour les vertus qu'on lui prête dans le commerce. Le 14 octobre 2026, le catalogue listait 48 associations pour rs1801133, et la plupart sont des mesures sanguines : homocystéine (7 lignes, avec des valeurs p jusqu'à 10⁻¹²⁰), folate (5), taille des globules rouges et teneur en hémoglobine (12), pression artérielle (4), glycine, volume des réticulocytes, bilirubine. Les autres sont des traits comme l'âge à la ménopause, l'épaisseur corticale et le débit de filtration rénale. Quatre lignes seulement sont reliées à une maladie, chacune issue d'une seule étude : sclérose en plaques (odds ratio 1,11, aucun intervalle de confiance rapporté), schizophrénie à début précoce (1,35, aucun intervalle), lèpre (0,81, aucun intervalle) et anémie par carence en folates (un effet donné sous forme de bêta dans des unités non précisées). rs1801131 a une seule ligne dans tout le catalogue, pour le tour de hanches.

Notre méthodologie ne garde une ligne dans le catalogue santé que si elle est significative à l'échelle du génome, reliée à une maladie, et qu'elle rapporte un odds ratio avec un intervalle de confiance plausible. Aucune des quatre lignes de maladie ne passe, et les lignes de mesures ne sont pas des maladies : aucun des deux rsID ne figure donc dans notre catalogue santé de 12 110 associations principales. (Nos catalogues sont construits à partir de la version du 2026-06-01 ; la ligne de l'anémie par carence en folates, un bêta dans des unités non précisées sans intervalle exploitable, échouerait à la même règle sur l'intervalle.) Le rapport nutrition suit une autre voie. Il tient rs1801133 à l'écart de ses tableaux folate et homocystéine, si bien que le variant ne compte jamais dans une tendance, et lit plutôt C677T dans une fiche gène imprimée à côté de l'homocystéine. La fiche montre votre génotype sur le brin plus et ce que de grandes études ont trouvé : dans une revue du CDC portant sur des études chez des femmes, deux copies allaient de pair avec des folates sériques inférieurs d'environ 13 % et des folates érythrocytaires inférieurs de 16 % par rapport à aucune ; une étude pangénomique de 44 147 personnes a trouvé une homocystéine plus élevée à chaque copie ; et sur 59 995 personnes, l'écart d'homocystéine entre deux copies et aucune était d'environ 3 micromol/L dans les régions d'Asie pauvres en folate, mais proche de zéro là où les aliments sont enrichis en acide folique. Elle donne aussi la position de l'ACMG et précise que le résultat n'est pas un diagnostic. A1298C (rs1801131) n'est pas affiché : l'annexe du rapport consacrée aux affirmations écartées explique pourquoi.

Pour être clair : aucun rapport Full Human n'évalue MTHFR ni n'en tire un verdict de méthylation, et c'est voulu. Le rapport de santé liste les variants ayant une association significative à l'échelle du génome et relie chaque ligne à son étude, comme le montre l'exemple de rapport ; le rapport nutrition y ajoute la fiche C677T avec son contexte, sans conseil de supplémentation. Si c'est une ligne MTHFR que vous cherchez, le tableau ci-dessus vous la donne déjà.

Ce que Genetic Genie et les autres outils rapportent à la place#

• Genetic Genie propose un panel de méthylation gratuit, financé par les dons, le panel où se trouve MTHFR, ainsi qu'un panel de détox. Votre fichier est envoyé ; le site indique que les fichiers envoyés sont supprimés sous 24 heures, et en général immédiatement après le traitement, et sa politique de confidentialité a été modifiée pour la dernière fois le 27 novembre 2019 (geneticgenie.org, politique de confidentialité, consulté le 14 octobre 2026).
• Promethease (25 $ par rapport, envoi du fichier requis ; promethease.com, consulté le 14 octobre 2026) renvoie la page de génotype SNPedia de rs1801133, qui pour AA affiche une magnitude de 2,8 et liste des études allant dans les deux sens (SNPedia, consulté le 14 octobre 2026).
• 23andMe propose désormais lui-même un rapport « Homocysteine (MTHFR-Related) » couvrant C677T et A1298C pour les membres 23andMe+ Premium, d'après l'article de blog cité plus haut ; son service Santé est vendu dans huit pays.
• Xcode Life affiche gratuitement un statut MTHFR à l'envoi du fichier et liste des rapports à l'unité de 30 $ à 69 $ (xcode.life, consulté le 14 octobre 2026) ; Genetic Lifehacks traite de MTHFR dans ses articles sur les gènes, en partie derrière un abonnement à 79,99 $ par an, et indique que votre fichier ADN est lu par votre propre navigateur et jamais envoyé (geneticlifehacks.com, consulté le 14 octobre 2026).

Chacun de ces outils imprime les deux mêmes lettres que vous pouvez lire dans le tableau, plus une interprétation, et c'est dans l'interprétation que les preuves s'amenuisent. Notre comparatif des outils d'analyse de données ADN brutes couvre le prix et l'endroit où chaque outil traite votre fichier.

Que faire si vous le portez#

La plupart des gens le portent : partez de là. Si vous êtes AG ou AA à rs1801133, rien dans les recommandations ci-dessus ne change pour vous sur la seule base du génotype ; la position de l'ACMG est que le test n'aurait même pas dû être prescrit pour évaluer le risque de caillots. Si l'homocystéine vous préoccupe, c'est une prise de sang, pas un génotype : un médecin peut la prescrire et l'interpréter au regard de votre alimentation et de votre statut en vitamines B. Le folate apporté par l'alimentation est la voie ordinaire. Nous ne donnons pas de conseils de supplémentation, et un site qui vend un « protocole de méthylation » fondé sur deux lettres dans un fichier texte ne devrait pas en donner non plus.

Deux situations justifient d'en parler sérieusement avec un professionnel. Si vous préparez une grossesse, la recommandation habituelle sur l'acide folique ne dépend pas de ce génotype ; parlez-en à un médecin ou à une sage-femme. Si quelqu'un dans votre famille a eu une homocystinurie ou une homocystéine très élevée, cela oriente vers les variants MTHFR rares, qu'un fichier issu d'une puce à ADN ne teste pas et qu'un laboratoire clinique teste. Dans les deux cas, l'étape suivante est un médecin ou un conseiller en génétique, pas un fichier brut.

FAQ#

23andMe teste-t-il MTHFR ?

Oui, de deux façons. Le fichier brut que chaque client peut télécharger contient rs1801133 (C677T) et rs1801131 (A1298C) ; SNPedia indique le premier sur toutes les puces 23andMe, de la v1 à la v5. Par ailleurs, le rapport « Homocysteine (MTHFR-Related) » de 23andMe montre les deux variants aux membres 23andMe+ Premium, et sa propre revue précise que les variants courants ne devraient pas être lus comme ayant un effet significatif sur la santé.

Quel est le rsID de MTHFR ?

Il y en a deux courants. C677T est rs1801133, à la position 11 856 378 du chromosome 1 sur l'assemblage GRCh37 ; A1298C est rs1801131, à la position 11 854 476. Dans un fichier 23andMe, AA à rs1801133 signifie deux copies de C677T et GG à rs1801131 deux copies de A1298C, car le fichier rapporte le brin plus et le gène se trouve sur le brin moins.

MTHFR est-il une mutation ?

Les variants courants s'appellent plus justement des polymorphismes : 677T est porté par environ 60 % des Européens et près des trois quarts des personnes d'ascendance américaine métissée, 13 % à 22 % en portant deux copies. Des mutations MTHFR rares causant l'homocystinurie existent, touchent moins d'une personne sur 200 000 et sont autre chose que C677T et A1298C.

Que signifie AG à rs1801133 ?

Une copie de C677T. Le G est la version courante et le A le variant 677T, écrit sur le brin plus comme le fait 23andMe. La revue de 23andMe situe l'homocystéine environ 10 % plus haut en moyenne avec une copie, en général toujours dans les valeurs normales, et la recommandation de l'ACMG de 2013 ne trouve aucune utilité clinique à la tester comme facteur de risque de caillots.

Full Human rapporte-t-il MTHFR ?

Pas sous forme de score. Le catalogue santé garde les odds ratios assortis d'un intervalle de confiance plausible et reliés à une maladie ; les lignes du catalogue pour rs1801133 sont surtout des mesures sanguines, et ses quatre lignes de maladie n'ont pas d'intervalle exploitable : aucun des deux variants MTHFR ne figure donc dans notre catalogue santé. Le rapport nutrition lit C677T (rs1801133) dans une fiche gène à côté de l'homocystéine : votre génotype, ce que de grandes études ont trouvé pour le folate et l'homocystéine, et la position de l'ACMG, sans tendance, sans verdict de méthylation et sans conseil de supplémentation. A1298C (rs1801131) n'est pas affiché. Les deux rapports sont générés dans votre navigateur et rien n'est envoyé, ce que vous pouvez vérifier vous-même.